1976年10月根据常熟县藕渠人民公社文件批复，组建常熟县藕渠化工厂，性质为社办集体企业。

1984年，与常熟制药厂合作，配合该厂生产安定、利眠宁和卡马西平医药中间体。另外还生产固体接枝剂、膨化剂等产品。

1990年2月，任命现任董事长邹振荣为常熟市藕渠化工厂厂长。

1990年10月同太原制药厂、上海第六制药厂、南京第二制药厂等合作，生产氯霉素原料药。

1992年同上海医药工业研究院合作开发6,8-二氯辛酸乙酯。

1994年先后同美国，澳大利亚等国有关企业合作成立合资公司。先后建立了常熟万兴化工有限公司，江苏万兴保健品有限公司，常熟维亚医药化工有限公司等中外合资企业。

1994年8月19日，常熟万兴化工有限公司被批准为中外合资企业。

1995年与中科院上海药物研究所合作开发硫辛酸，成为国内首家开发和生产硫辛酸的公司。

1997年下半年，硫辛酸大举进入美国市场，出口供不应求。

2001年，公司彻底改制，公有股从企业退出，成立股份有限公司，企业独立自主经营管理。

2001年公司通过ISO9002认证。

2002年4月，成立江苏同禾药业有限公司。

2004年公司正式搬迁至东南经济开发区，新厂全面进入试生产。投入2000万元改建扩建分析检测试验中心。

2005年公司通过ISO14001国际环保体系认证和GB/T28001(OHSASI8001)职业健康与安全管理体系认证。

2005年公司通过药品固体制剂GMP认证。

2006年1月，江苏同禾药业有限公司控股湖南洞庭药业股份有限公司。

2006年公司通过保健食品GMP认证。

2007年，取得硫辛酸等原料药批准文号并通过GMP认证。

2009年，新的GMP制剂厂进入设备调试阶段。